问题分析:巧克力囊肿要手术治疗。巧克力囊肿地看看大小,如果巧克力囊肿特别大,并且症状很明显,短时间内未曾生育,必须马上手术,因为巧克力囊肿影响生育的。要是痛经不是很明显,短时间内没有生育要求,也可以用药物来治疗。巧克力囊肿最根本的治疗方法还是手术会更好一些。手术采用腹腔镜手术,效果很好。术后打针阻断内膜异位症的复发,阻断巧克力囊肿复发可以用一些药。所以,治疗巧克力囊肿的方法就是手术治疗。