问题分析:巧克力囊肿是有可能会复发的,巧克力囊肿一般是由于子宫内膜异位症造成的,一般如果巧克力囊肿比较大,建议进行手术治疗,手术治疗之后可以在医生指导下服用药物来治疗子宫内膜异位症,如果子宫内膜异位症恢复到正常,是不会再复发巧克力囊肿的。可去正规医院检查后确定治疗方案。