问题分析:巧克力囊肿主要是指,子宫内膜的间质或者腺体异位到卵巢,异位的子宫内膜在月经期也可以出现剥脱出血,从而形成巧克力囊肿。要想从根本上治疗巧克力囊肿,只有两种办法,第一,切除双侧卵巢,手术过程中会将巧克力囊肿一并切除,因为卵巢是女性的内分泌器官,切除卵巢,激素水平下降,女性就不会再来月经,手术后残存的巧克力囊肿慢慢就会萎缩吸收。