一般情况下，卵巢囊肿可以通过活检来确认囊肿是否为良性，具体内容如下：
卵巢囊肿是良性还是恶性，通常要到医院做妇科肿瘤标记，如果是良性的，那就是有一定的几率。正常情况下，有恶性的可能性，比如血液ca125升高，或者是子宫内的巧克力囊肿，属于良性的。因此，要做好术前做一次简单的组织学分析，确定卵巢囊肿的具体情况，做简单的病理检查是不准确的。

卵巢囊肿绝大多数都是良性的。但是也有发生恶性病变的可能。卵巢囊肿的超声检查结果来看，应该是良性的。但是卵巢囊肿体积过大，有发生卵巢囊肿蒂扭转，破裂，感染等严重并发症的。即使是良性的，也应该尽快进行手术治疗。

介于良性和恶性之间的卵巢囊肿称为交界性卵巢囊肿，又称低恶性潜能肿瘤，有向恶性转变的可能，但也可向良性转变，通常交界性卵巢囊肿其预后较好，对于尚未生育的年轻病人可以行保留生育功能的手术。卵巢交界性治疗方法是微创腹腔镜联合手术治疗，复发较少。

通常情况下，良性卵巢囊肿可以通过手术来治疗。具体分析如下：
卵巢囊肿是卵巢常见的良性肿瘤，由于卵巢囊肿不会具有恶变的可能，因此，临床上对于没有临床症状卵巢囊肿可以不给予任何处理，单纯给予临床观察即可，常规进行超声检查，妇科检查和化验肿瘤标志物CA-125检查即可。但是，对于卵巢囊肿较大，伴有压迫、阻塞周围组织器官功能的，或者因为卵巢囊肿可能导致蒂扭转危险的患者，则建议手术治疗。

不一定，良性或者恶性可从患者的症状和生长速度等方面进行判断良性的卵巢囊肿一般生长慢，不良反应少，恶性的囊肿会迅速的长大，有时可能会有流血，腹痛等症状存在。良性囊肿多发生在生育期妇女身上;而恶性囊肿一般发作于青春期前少女、青少年或绝经后妇女。早期即有转移病灶，并迅速出现消瘦等恶性病变表现。体征：良性者常为单侧，可活动，表面光滑，包膜完整，囊性，不伴腹水;而恶性者有时为双侧，不活动，与周围组织常有粘连，部分为实性，表面不光滑，可能穿破包膜，种植在腹腔或盆腔内，在子宫直肠陷凹处可触到固定的结节，常伴有血性腹水，如抽吸腹水检查可能查到癌细胞。禁忌：1、饮食宜清淡，饮食应富含足够的营养，纠正偏食及不正常的饮食习惯，不宜常食刺激性、海产品等。2、适宜食物：牛奶、菠菜、山药、白菜、油菜、香菇、瘦肉、鸡蛋、鲫鱼、苹果、鸭梨、大枣、花生、黑米等。3、禁忌食品：蟹、带鱼、青鱼、鹅肉、狗肉、辣椒、生葱、生蒜、桂圆、橘子、白酒等。4、避免高度紧张及精神刺激，保持乐观情绪及充足睡眠。

最主要的诊断还是把囊肿拨下来送病理做化验。病理切片诊断治疗，在临床上，一部分的辅助检查也会判断。囊肿更趋向于良性还是恶性，在临床上，一兜水样的囊肿里边就是超声提示是无回声，这种良性的可能性会更大；如果囊肿提示是囊实性，里边有实性成分，有特殊的血流信号，尤其是低阻的血流信号，要警惕会不会是恶性，术中也可能会送冰冻，最后的诊断还是靠石蜡切片才能证实是良性还是恶性。

卵巢功能多属于良性的病变，恶变的几率是比较低的，卵巢囊肿大小和边界是否清楚，平时的月经周期是否正常，如果出现了明显并发症等，也可以通过手术的方式来治疗，手术后反复的几率比较低。

卵巢囊肿良性恶性不能从症状来判断的，主要还是通过病理检查才可以确诊的。如果囊肿大或者疼痛比较严重那可以选择手术的，注意不要有压力，囊肿出现癌变的几率是比较低的。

良性卵巢囊肿病程长，囊肿逐渐长大，多无不适症状；而恶性者病程短，囊肿迅速长大，且有时可伴有发热。良性者多为生育期妇女，情况良好；而恶性者发病多见于青春期前少女、青少年或绝经后妇女，病情发展快。