一般情况下，良性卵巢囊肿可能会导致CA125轻微升高，具体分析如下：
良性卵巢囊肿有可能会导致CA125出现轻度升高，一般是由于卵巢巧克力囊肿导致的。结合病史，如果有痛经的病史并且进行性加重，还可能会不孕不育，另外半个月再复查的时CA125值没有改变，基本上就可以考虑是卵巢巧克力囊肿。
对于卵巢巧克力囊肿患者，建议尽快手术治疗，术后为了预防复发还要用相应的药物，连续用药三个月经周期或半年的时间。

一般情况下，如果患者的卵巢囊肿为生理性囊肿，卵巢囊肿CA125通常不会高；如果是病理性的则可能会高，具体内容如下：
CA125是一种糖蛋白复合物，有助于诊断患者的疾病，而卵巢囊肿CA125是否会增高需要根据其类型进行判断，并不能笼统地一概而论。如果女性体内存在生理性的卵巢囊肿，如卵巢滤泡囊肿、卵巢黄体囊肿等，此时，CA125通常不会比较高。但是，如果患者患有子宫内膜异位症、结核性腹膜炎等病症，检查结果可能会提示CA125偏高。

卵巢囊肿会导致CA125增高，CA125是一种常见于卵巢上皮癌的肿瘤标志物，这种病人在检查时会出现CA125高于正常值。但在某些特定的条件下，也会引起盆腔炎、子宫内膜异位症、卵巢囊肿等疾病，特别是50岁以下的女性，CA125增高并不一定就是卵巢癌。女性50岁以上的女性，CA125水平增高，需要密切关注。

一般情况下，卵巢囊肿可以通过活检来确认囊肿是否为良性，具体内容如下：
卵巢囊肿是良性还是恶性，通常要到医院做妇科肿瘤标记，如果是良性的，那就是有一定的几率。正常情况下，有恶性的可能性，比如血液ca125升高，或者是子宫内的巧克力囊肿，属于良性的。因此，要做好术前做一次简单的组织学分析，确定卵巢囊肿的具体情况，做简单的病理检查是不准确的。

卵巢囊肿分为生理性囊肿和病理性囊肿，通常为良性囊肿，几乎没有恶性病变。如果生理性囊肿在黄体囊肿中很常见，通常随着月经而变化，也就是说，可以发现在下次月经干净后逐渐减少甚至消失。病理囊肿不能消失。如果没有症状，不太直接的症状暂时不需要手术。定期的症状检查可以结合药物进行。如果囊肿逐渐增大，如果直径大于5厘米，月经和腹痛症状都会受到影响。有手术特征的，可以选择腹腔镜或开腹手术进行切除。

通常情况下，良性卵巢囊肿可以通过手术来治疗。具体分析如下：
卵巢囊肿是卵巢常见的良性肿瘤，由于卵巢囊肿不会具有恶变的可能，因此，临床上对于没有临床症状卵巢囊肿可以不给予任何处理，单纯给予临床观察即可，常规进行超声检查，妇科检查和化验肿瘤标志物CA-125检查即可。但是，对于卵巢囊肿较大，伴有压迫、阻塞周围组织器官功能的，或者因为卵巢囊肿可能导致蒂扭转危险的患者，则建议手术治疗。

定期做检查。可以3到6个月做一次B超检查，看看暖巢囊肿是否长大，或者有没有其他的变化。只要增长，大小没有变化，可定期检查。无需用药治疗。如增长过快，伴随腹部疼痛不适等症状，可考虑手术治疗。

良性卵巢囊，子宫切除发生于近绝经期或绝经期妇女的一侧或双侧卵巢囊肿病人全身情况不能胜任，双侧附件及全子宫切除为宜，但会严重影响内分泌失调。卵巢囊肿切除术：病人多无月经障碍，甚至有合并妊娠者，有的一侧肿瘤较显着，则可行患侧输卵管卵巢切除术。输卵管卵巢切除术：一侧卵巢囊肿发生于年龄较大）病人周身情况不能胜任或炎症严重者常行全子宫切除术，应不计切口大小。

卵巢囊肿癌胚抗原会升高，肿瘤状态时，会使得机体一些“关闭”的基因激活，出现了返祖现象，而重新开启并重新生成和分泌这些胚胎、胎儿期的蛋白。其中癌胚抗原就是正常胚胎组织所产生的成分，出生后逐渐消失，或仅存极微量。当细胞癌变时，此类抗原表达可明显增多。