你好，我怀孕已有两个月多了，可是有阴道炎，经常便秘，肚子两侧

问题分析：你好,从优生学讲是有一定的影响的,但是不是一定会导致畸形。
这种情况需要严格做好孕期的检查,在孕14-19周做唐氏筛查,孕22-26周做四维彩超产前排畸,若是有必要16-20周做羊水穿刺及脐血分析,这样可以明确宝宝在宫内的发育情况，建议保留宝宝,做定期的孕检,如果发现宝宝有异常,及时终止妊娠。

问题分析：你好，所述情况可能是子宫附件炎症导致的腹部两侧疼痛，伴有阴道炎和便秘，如果不及时治疗，可能影响胎儿正常发育和生长的。
应该到医院检查一下B超、白带常规，确诊后可以根据感染病原体积极治疗阴道炎和子宫附件炎症，少食多餐，养成每天排便的习惯，多吃水果蔬菜和多喝水，缓解便秘症状，做好孕期保健和定期孕检，祝健康顺利。